A gestão municipal de Santo Antônio de Jesus foi classificada como a 3ª melhor da Bahia pelo Índice de Governança Municipal (IGM), ranking elaborado pelo Conselho Federal de Administração (CFA), considerando dados referentes a 2018. O município obteve nota 6.78 no quesito, alcançando a 3ª posição no estado e a 79ª posição no ranking nacional. No ranking geral, Santo Antônio de Jesus ainda alcançou destaque se classificando como o 6º município mais competitivo da Bahia. O índice considera dados das áreas de saúde, educação, gestão fiscal, habitação, recursos humanos, transparência, violência, dentre outros, para atribuir uma nota a cada município em três pilares: finanças, gestão e desempenho.  Com os resultados do IGM, os municípios se consolidam pelas boas práticas de gestão e governança.